三位小魔仙希雅、海昕和夏凡在化解了海萤堡的灾难后，回到人类世界-悦悠岛，成为了海洋保育馆的见习保育员。在保育馆的见习生活中，她们学习了解到各种海洋知识，并积极参与到救助海洋生物的行动中。 然而，一个自称“铁鹰战队”的神秘团队突然造访悦悠岛，利用各种高科技装备，四处捕捉各种海洋生物。这一切原来是精于制造各种机器的幻仲博士在幕后指使的，希雅、海昕、夏凡三人随即用魔仙力量与之展开一场保护海洋生物的战斗……
身为人类的海昕和夏凡，因为一次偶然的机会，得到了梦寐以求的魔法能量。并在魔仙希雅的同意下，成为了小魔仙，和希雅一起守护人类世界和魔法海洋。她们在帮助希雅调查污染魔法海洋的海兽时，结识了海萤堡的海达王子及其他一众魔仙。众人在寻求真相的路上遇到了很多困难，但大家团结一致，共同努力，一起渡过了重重难关。
八凰幸人是一名在儿童福利院长大的少年。某天，名为沙川尽义的神情傲然的青年来到了幸人的身边，他自称是幸人已故父亲的弟子，把幸人带去了故乡绫之岛。由七岛相连的绫之岛，盛行着火与水之龙的传说，还有名为“御灵”的神奇事物存在着的奇妙的岛屿。幸人与曾经是守护绫之岛仙人的父亲的三名弟子开始了来往，一同居住在绫之岛上。然而另外两名师兄弟鞍马春秋与伊吹朱之间却有着深深的隔阂。在平衡即将开始崩坏的“ayakai”岛上，幸人直面的真相是一—
