故事发生在一个存在着魔力的世界之中，在这里，魔力只出现在年幼的少女们身上，随着年岁渐长，这种魔力会慢慢减弱直至消失不见。随着时代的发展和科技的进步，少女们身上这种神秘的力量获得了越来越多的重视和使用，而这些天真而又单纯的少女们，开始活跃在各行各业的前沿位置。某日，一种充满了攻击性的异形生物忽然出现，人们称之为“内伍罗伊”，当内伍罗伊的侵略有着越来越强劲之势头时，魔女们挺身而出。
　　开朗乐观的宫藤芳佳（福圆美里 配音）、实力强大雷厉风行的坂本美绪（千叶纱子 配音）、大大咧咧丢三落四的莉涅特（名冢佳织 配音）、自信满满高傲可爱的佩瑞妮（泽城美雪 配音），为了保护赖以生存的家园，她们随时做好了付出生命的准备。

　　某天，阿笠博士通过灰原哀邀请少年侦探团的来他的研究所。当孩子们到达时，却得知阿笠博士被人绑架。原来，这只是博士跟大家做的小游戏，在第一关里，他提示少年侦探们需从三个不同的方向来某一地点与之会合。这样的考验对柯南来说自然不成问题，但对文太、步美和光彦三人来说却是一个大的挑战。经过柯南的提示，三人成功找到问题的关键，顺利抵达目的地，等待他们的则是博士的第二道问题。
　　另一方面，阿笠博士在设置游戏的过程中险些遭遇车祸，结果发现司机竟是绑匪，他也因此遭到劫持。绑架游戏弄假成真，少年侦探团最终能否成功救出博士呢？

1792年，江户最黑暗的时代，剑士万次（关智一 配音）杀死自己的恶官上司之后开始了逃亡的路途。在逃亡中，他又在无意之中杀死了前来追捕的妹夫。后悔莫迭的万次想要放下屠刀，但形势的逼迫又让他不得不继续战斗下去。万次的体内被八百比丘尼埋入了一种叫做“血仙虫”的异物，这种异物可以让宿主拥有不死之身，但同时也会带给宿主无尽的痛苦与折磨。为了解开这不死的诅咒，万次决定斩杀一千个恶人来赎回自己曾经所犯下的罪孽。                                    
                               　　在千人斩的过程中，万次结识了背负着黑暗命运的少女凛（佐藤利奈 配音）。万次被凛的身世打动决心为她报仇，而之后，凛的敌人便像走马灯似的一一登场。在万次不断麻木的挥刀斩杀时，悲伤的他开始渐渐的有了疑惑，杀一百人也好，一千人也好，这个世界真的会就此变好吗？就在万次动摇的时候，另一双眼睛正虎视眈眈的盯着他所拥有的，珍贵的不死之身。

10年的时间可以让少年变成青年，可以让性格温顺的乖学生变成脾气暴躁性格别扭的上班族，让很多事情被忘记，但有些事情却永远无法被洗刷掉。10年前的小野寺律（近藤隆 配音）暗恋着学长嵯峨前辈（小西克幸 配音）。得到前辈回应的律本以为就此可以幸福下去了，哪知因为误会让二人分离，一别10年。律被调到了出版公司的漫画部门，而他的上司居然就是当年的初恋对象，虽然姓氏变了，但分明就是当初那人。嘴上说着麻烦死了讨厌死了的律，心里却依然会因为前辈的一点点温柔而心动，难道他阔别10年爱上的人依然还是初恋对象么？一出出有趣又温柔的故事在漫画编辑部展开。                                    
                               　　除了律的场合，还有编辑部其他成员的故事，同样精彩。

青野月音（岸尾大辅 配音）是一个平凡的少年，机缘巧合之下，考试落榜的他进入了阳海学园开始了崭新的高中生活。谁知道，阳海学园是一所聚集了各路妖怪的妖怪学园，还不知情的青野在这里会有着怎样的命运呢？在学园里，名叫赤夜萌香（水树奈奈 配音）的娇俏少女让青野久久不能忘怀，而他 不知道的是，萌香的真实身份其实是吸血鬼。此外，拥有催眠能力的梦魔黑乃胡梦（福圆美里 配音），古灵精怪的魔女仙童紫（古山贵实子 配音），跟踪狂雪女白雪美逸（钉宫理惠 配音），这些外表或是性感或是可爱的妖怪们接连出现在了青野的身边，并对青野发出了求偶的信号。一时间，青野陷入了难以抉择的境地。

　　冢本天满是高中2年生。和许多的女孩子一样，她也在恋爱。但是，她一直没能向她非常喜欢的人——同班同学的乌丸大路表白爱意。
　　天不佑人！她突然知道了乌丸还有1年就要转校了这件事!!尽管如此，她还是得到了妹妹——八云和友人们的协助，为了告白一会化装成护士，一会试着发出箭书……还有一个喜欢这样的天满的高中2年生——播磨拳児(是个不良少年)。虽然也是那么的喜欢天满，但是和天满一样，无法向喜欢的人传达自己的爱意，过着消沉的每一天……
　　但是播磨在目击到天满和乌丸一起吃午饭后，伤心悲哀的他于是就拒绝去上学，开始了流浪的旅行……